La Universidad Centro Médico Bautista nace en el año 2009, con los objetivos de sostener, continuar, promover, fortalecer y mejorar las actividades hasta hoy desarrollado por la Institución denominada Hospital Bautista, con asiento en la ciudad de Asunción, tendiente al cuidado, protección y restablecimiento de la Salud física, mental y espiritual de la población.
Promover la formación, capacitación y entrenamiento el personal médico, paramédico y otros profesionales de la salud para mejorar la prestación de sus servicios en el Centro Médico Bautista y otras instituciones asistenciales del país, públicas o privadas.
Fomentar y promocionar la investigación científica tendiente a aportar nuevas técnicas y conocimientos a las Ciencias Médicas que contribuyan a mejorar o restablecer la salud humana. En este objetivo se incluyen el otorgamiento de ayudas pecuniarias personales, becas y cursos de entrenamiento para profesionales de la salud y otros funcionarios, para su formación y capacitación profesional.